La Codoñera pertenece al grupo de términos municipales que poseen un carácter de transición en su territorio. Una amplia llanura agrícola envuelve el entorno de la población, destacando los campos de olivos, almendros y bosquetes de pinar y monte bajo. El sector este del término posee un relieve más elevado, con prolongadas laderas en su mayor parte cubiertas por el pinar de carrasco, que conforme más nos alejamos más carácter forestal tiene.
Por último, el río Mezquín constituye el límite de este término por su sector oeste. En este espacio encontramos algunas huertas y el estrecho cauce de frondosa vegetación que constituye el río y sus márgenes.
